Termični cikli: Termalni ciklilec je jedra komponenta PCR analizatorja, ki se uporablja za nadzor ciklične reakcije reakcijskega encima in ciljnega vzorca pri različnih temperaturah. Termični kolesar lahko doseže hitro spreminjanje temperature skozi Peltierjeve elemente ali druge tehnologije in ohrani določeno temperaturo v vsakem ciklu. Termični kolesar običajno vključuje enega ali več reakcijskih modulov, od katerih lahko vsak neodvisno nadzoruje temperaturo in čas, da doseže sočasno odkrivanje več vzorcev.
Optični sistem: Optični sistem se uporablja za zaznavanje in merjenje fluorescentnega signala, ki nastane s PCR reakcijo. Optični sistem lahko določi prisotnost in količino cilja z vznemirjanjem fluorescenčnega markerja (kot so FAM, Hex ali Rox) in zazna intenzivnost fluorescence. Optični sistem običajno vključuje enega ali več virov vzbujanja, kot so LED ali laserske luči, in fluorescenčni detektor, kot sta PMT (fotomultiplikatorska cev) ali CCD (Electronic Imaging Chip).
Programski sistem: Programski sistem se uporablja za nadzor obratovanja in analize podatkov PCR analizatorja. Na splošno lahko programski sistem analizatorja PCR nastavi reakcijske pogoje, spremlja reakcijski napredek, zapiše podatke o reakciji in analizira rezultate. Programski sistem je mogoče povezati s PCR analizatorjem prek USB, serijskih vrat ali omrežja in ponuja grafični vmesnik in orodja za analizo podatkov.
Sistem vzorčenja: Sistem vzorčenja se uporablja za nalaganje in mešanje reakcijskega sistema PCR. Običajno lahko sistem vzorčenja samodejno naloži vzorce in druge spojine, kot so prajmerji in encimi, in jih premešajo in oddajajo, preden se reakcija začne. Sistem vzorčenja lahko doseže nalaganje in razprševanje vzorcev po cevi, brizgah ali drugih sredstvih.
Sistem vezja: Sistem vezja se uporablja za nadzor in spremljanje delovnega stanja analizatorja PCR, vključno s temperaturo, časom, intenzivnostjo fluorescence in drugimi parametri. Sistem vezja lahko implementira mikrokontroler, digitalni procesor signala ali druge elektronske komponente.
Mehanski sistem: Mehanski sistem se uporablja za premikanje, prilagajanje in nadzor mehanskih delov analizatorja PCR, kot so termični kolesar, optični sistem in sistem za vzorčenje. Mehanski sistem lahko implementira prenosnik, pogonski sistem in senzorski sistem.